在电子显微镜下才能观察到的细胞结构被称为：亚显微结构。

亚显微结构又称为超微结构。指在通俗光学显微镜下不雅察看不能分辩清楚的细胞内各类微细结构。(通俗光学显微镜的分辩力极限约为0.2微米，细胞膜、内质网膜和核膜的厚度，核糖体、微体、微管和微丝的直径等均小于0.2微米，因而用通俗光学显微镜不雅察看不到这些细胞结构，要不雅察看细胞中的各类亚显微结构，必需用分辩力更高的电子显微镜。) 　　能够在电子显微镜下看到的直径小于0.2微米的细微结构,叫做亚显微结构。

电子显微镜的首要组成部门是：

　　电子源是一个释放自由电子的阴极，一个环状的阳极加速电子。阴极和阳极之间的电压差必需很是高，一般在数千伏到3百万伏之间。

　　电子透镜用来聚焦电子。一般使用的是磁透镜，有时也有使用静电透镜的。电子透镜的浸染与光学显微镜中的光学透镜的浸染是一样的。光学透镜的焦点是固定的，而电子透镜的焦点可以被调节，是以电子显微镜不象光学显微镜那样有可以移动的透镜系统。

　　真空装配。真空装配用以保障显微镜内的真空状况，这样电子在其路径上不会被领受或倾向。

　　样品架。样品可以不变地放在样本架上。此外往往还有可以用来改变样品（如移动、动弹、加热、降温、拉长等）的装配。

　　探测器，用来收集电子的旌旗灯号或次级旌旗灯号。
 

　电子显微镜按结构和用途可分为透射式电子显微镜、扫描式电子显微镜、反射式电子显微镜和发射式电子显微镜等。透射式电子显微镜常用于不雅察看那些用通俗显微镜所不能分辩的细微物质结构；扫描式电子显微镜首要用于不雅察看固体概况的描摹，也能与 X射线衍射仪或电子能谱仪相连系，组成电子微探针，用于物质成分剖析；发射式电子显微镜用于自觉射电子概况的研究。

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